O museu apresenta, hoje, um circuito de exposição de longa duração distribuído por núcleos que, conceitualmente, procuram representar as funções originais da Casa de Intendência e Fundição do Ouro de Sabará, as principais técnicas e processos utilizados na extração do ouro e os hábitos e costumes de parte da sociedade mineira do século XVIII.  No pavimento térreo do museu encontram-se os seguintes núcleos: “Os Modernistas e o Museu do Ouro (século XX)”, “A Real Casa da Intendência e Fundição do Ouro de Sabará (século XVIII)”, “A Extração do Ouro de Aluvião (século XVIII)”, “A Extração do Ouro de Veio (século XIX)” e “Maquetes Didáticas (extração do ouro de aluvião e veio)”. Já no pavimento superior o museu apresenta outros quatro núcleos, a saber: “A Sala dos Quatro Continentes (século XVIII)”, “A Religiosidade na Sociedade Mineradora (séculos XVIII e XIX)”, “Sala das Porcelanas (século XIX)” e “A Residência do Intendente – salas ambientadas (século XVIII): Quarto de Donzela, Escritório e Quarto do Rico Minerador”.